I Luleå skärgård blandas olika naturmiljöer på ett synnerligen intressant sätt. Intressanta fenomen är den mångskiftande naturen med varierande biotoper som tillfredsställer många olika arter och hur artförekomsten förändras desto längre ut i havsbandet man kommer.
Det finns vid skärgårdens stränder några arter som är av speciellt intresse - det är i första hand de endema arterna - strandögontröst (Euphrasia bottnica) och bottenviksmalört (Artemisia bottnica) och gultåtel (Deschampsia bottnica). Många av öarna i skärgården hyser både ett skogslandskap likt inlandets skogar och ytterskärgårdens så typiska kala hedar och klippor. Till öarnas skogar söker sig skogslandets fåglar - ripor, orrar och tjädrar men däremot söker sig aldrig vissa av havsfåglarna - tobisgrisslor, tordmule, m.fl. in mot fastlandet. De häckar i klippskrevor ofta ytterst mot havet.